GABEDIT

Gabedit adalah antarmuka pengguna grafis untuk paket kimia komputasi seperti Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem. Hal ini dapat menampilkan berbagai hasil perhitungan termasuk dukungan untuk sebagian besar format file utama molekul. The “Molekul Builder” canggih memungkinkan untuk cepat sketsa dalam molekul dan memeriksa mereka di 3D. Grafik dapat diekspor ke berbagai format, termasuk animasi.Gabedit tersedia di beberapa situs penyedia software gratis antara lain di sourceforge.net

Cara Install Aplikasi Gabedit yaitu:

• Buka Ubuntu Software Center 

Pilih  Science and Engineering  di pilihan sebelah kiri lalu pilih Chemistry, akan muncul tampilan seperti ini:

Pada gambar di atas sudah ada tanda centangnya, hal ini berarti aplikasi tersebut sudah di install, apabila belum dicentang pilih  install  pada tulisan remove di atas  atau klik more info lalu  install (sesuai aplikasi yang dipilih).

• Dengan terminal emulator

Buka terminal operator dan ketikan  sudo apt-get install gabedit  setelah tulisan yang sudah ada di terminal tersebut, tampilannya:

Setelah di install, buka aplikasi gabedit dengan tampilan awal:

Fitur-fitur utama

• Gabedit dapat Membuat file input untuk GAMESS (AS), GAUSSIAN, Molcas, MOLPRO, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem.
• Gabedit grafis dapat menampilkan berbagai Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess, Q-Chem, (sebagian) ErgoSCF dan (sebagian) ADF hasil perhitungan, termasuk yang berikut
  
  • Molecular orbital.
  • Permukaan dari kerapatan elektron, potensial elektrostatik, NMR kepadatan perisai, dan properti lainnya.
  • Permukaan dapat ditampilkan dalam mode jala padat, tembus dan kawat. mereka dapat colorcoded oleh properti terpisah.
  • Kontur (colorcoded), Pesawat colorcoded, Dipole. XYZ sumbu dan sumbu utama molekul.
  • Animasi dari mode normal sesuai dengan frekuensi getaran.
  • Animasi rotasi geometri, permukaan, kontur, pesawat colorcoded, xyz dan sumbu utama molekul.
  • Animasi kontur, Animasi pesawat colorcoded.
• Gabedit dapat menampilkan spektrum UV-Vis, IR dan Raman dihitung.
• Gabedit dapat menghasilkan file Povray untuk geometri (termasuk ikatan hidrogen), permukaan (termasuk permukaan colorcoded), kontur, pesawat colorcoded.
• Gabedit dapat menyimpan gambar di BMP, JPEG, PNG, PPM dan format PS.
• Gabedit otomatis dapat menghasilkan serangkaian gambar untuk animasi (getaran, konvergensi geometri, rotasi, kontur, pesawat colorcoded).
• Simulated Annealing dengan Dinamika Molekuler diimplementasikan dalam Gabedit (menggunakan Amber 99 parameter molekul mekanik).

Untuk menggambar sebuah molekul Pilih Geometry -->  Draw. Kemudian gambar molekul dengan mengklik gambar pensil (insert/ change atoms or bond), tampilannya:

Semoga Bermanfaat ^^