Avogadro adalah software kimis gratis, open source, tersedia dalam berbagai platform sistem operasi merupakan editor molekul yang dirancang untuk digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro yang tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X. Kode sumber-sumber tersedia di bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya sangat kecil (tidak lebih dari 10 MB). tampilan yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat keras kebanyakan sekarang. Apa yang dapat dilakukan Avogadro?
- Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari PDB (protein data bank) atau PubChem (database dari molekul kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis)
- Inovatif "auto-optimation", alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun dan memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.
- Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.
- Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.
- Embedded interpreter Phyton.
- Terjemahan tersedia dalam 19 bahasa lebih, termasuk antar muka juga sudah bisa berbahasa Indonesia, tersisa hanya beberapan bagian saja yang belum dialihbahasakan.
- Cross-Platform : Molekul pembangun/editor untuk Windows, Linux, dan Mac OS X.
- Intuitif : Dibangun untuk dapat digunakan dengan mudah bagi mahasiswa dan peneliti lebih lanjut.
- Cepat : Mendukung multi-threaded rendering dan komputasi.
- Extensible : Plugin arsitektur bagi pengembang, termasuk rendering, tool interaktif, perintah, dan skrip Phyton.
- Fleksible : Fitur OpenBable yang dapat gidunakan untuk impor file-file kimia lain, input untuk beberapa paket kimia komputasi, kristalografi, dan biomolekul.
Tutorialnya dapat dilihat atau diunduh dari sini. Ada juga tutorial dalam bentuk videonya, silahkan kunjungi http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Tutorials
Untuk menginstall aplikasi Avogadro pada Linux ada tiga cara yaitu sebagai berikut.
- Menggunakan Terminal
- Ketik cd spasi/etc/apt/
- Kemudian sudo gedit source.list
Akan muncul password : password ini adalah password Linux Anda (password tidak akan terlihat, maka hati-hati memasukkan password Anda).
- Jika Anda ingin terhubung dengan Repo Unnes, ganti http:........co.id (yang ada pada masing-masing layar Anda) dengan http://repo.unnes.ac.id/repo/ (dengan cara mengganti = search kemudian replace)
- Lanjutkan dengan mengetik sudo apt-get update
- Ketik sudo apt-get install Avogadro
- Lalu tekan tombol enter
- Menggunakan Synaptic
- Klik administration
- Kemudian pilih synaptic packed manager
- Pilih science (untuk aplikasi tentang science)
- Ketikkan kata "Avogadro" pada kotak search
- Klik kanan kotak yang masih berwarna putih (mark for installation)
- Klik Apply
Tidak ada komentar:
Posting Komentar